MDAnalysis 是一个开源的 Python 库,旨在提供一个高效且灵活的方式来分析和处理分子动力学(MD)模拟数据。它可以从不同的文件格式中读取模拟轨迹和结构数据,进行复杂的数据处理和分析,广泛应用于生物物理学、化学、材料科学等领域。 一、创建虚拟环境 为了能够顺利安装,减少出错的概率,建议在新的虚拟环境中安装它。 conda create -n MDAnalysis python=3.8 -y conda activate MDAnalysis 二、安装MDAnalysis